Священная Британская Империя занимает одну треть всего мира и является самым могущественным государством. Британия нападает на Японию, и в ходе непродолжительной войны Япония теряет свой суверенитет и входит в состав Британской Империи, переименовываясь в Зону 11. Отныне жители Японии зовутся "одиннадцатыми" и подвергаются дискриминации» «2017 год. Молодой британец, ученик академии Эшфорд Лелуш Ламперуж случайно попадает в разборку между британскими солдатами и японскими террористами. Совершенно случайно он находит в машине террористов капсулу с девушкой, которая защищает его своим телом, когда того пытаются убить. Лелуш получил от неё особую силу - Гиасс, сила, которая позволяет подчинить себе любого человека. На самом деле, Лелуш никто иной, как одиннадцатый принц и семнадцатый наследник Британского трона. Он решает отомстить за смерть своей матери и создать мир, в котором его сестра Наннали будет жить счастливо. Первое, что он предпринимает - убивает своего брата, принца Кловиса.
Игра начинается на следующий день после убийства принца.